简要描述:
详细介绍
EUROSCARF 收集中心已建立,用于存放和交付基因组分析网络中生成的生物材料。其中包括以下项目:BMBF(325 个 ORF)、EUROFAN I(800 个 ORF)和作为*酵母基因缺失项目(6000 个 ORF)一部分的 EUROFAN II。当可用时,含有缺失盒或互补基因的质粒也有库存。缺失菌株的遗传背景因项目而异。在许多情况下,您可以选择不同的遗传背景。 德国酵母功能分析项目 在 BMBF(Bundesministerium für Bildung und Forschung)支持的德国酵母功能分析项目(1994-1997)期间,325 个基因已被删除。 15 个实验室的合作致力于基因的缺失和缺失菌株的功能分析(Entian 等:Mol Gen Genet 262 (1999) 683-702)。所有缺失均在菌株 CEN.PK2 中完成。由于该项目的早期启动,大多数基因缺失是通过用营养缺陷型标记替换感兴趣的基因来实现的。大约三分之一的缺失是通过 PCR 技术进行的。出于这个原因,有多种转化标记可以用来替换基因。从这个项目 EUROSCARF 拥有交配类型和杂合二倍体菌株的单倍体菌株。只有杂合二倍体可用于必需基因。该项目贡献的菌株可以通过登录号中的前 B 后跟 4 位数字代码和终端字母来识别。 EUROFAN I |
115 个团体的合作得到了欧盟的支持。该项目始于 1/96,800 个开放阅读框被删除和分析。每个参与实验室都负责删
除和初步分析六个基因 (sixpack)。 Wach 等人已经制定了删除策略。 (酵母 10 (1994) 1793-1808)。该策略基于 PCR 片段删除相应的开放阅读框。缺失存在于三种不同的遗传背景中。必须删除 FY1679 背景中的所有开放阅读框,与 S288C 同基因,S288C 是酿酒酵母基因组测序的来源。除了大多数基因的缺失之外,在 CEN.PK2 或 W303 中还产生了一组额外的缺失,以证明缺失盒是普遍使用的。在第一阶段构建的菌株通过登录号中的 5 位数字代码后跟对应于菌株交配类型的终端字母来标识。 根据EUROFAN I的指导方针,还收集了所有缺失质粒。除此之外,对于大多数基因,还有用于互补缺失基因的质粒。 *基因缺失项目(EUROFAN II) 在*范围内,欧洲和海外实验室联合在 Saccharomyces 基因组缺失项目联盟中(Winzeler 等人:Science 285 (1999) 901-906)。欧洲任务被标记为 EUROFAN II。所有构建的菌株将由 EUROSCARF 收集。缺失是在与 S288c(其 DNA 序列已确定的酿酒酵母菌株)同基因的遗传背景中进行的。 II期构建的缺失菌株均在BY菌株系列的遗传背景中。 这些菌株的 EUROSCARF 登录号与 Saccharomyces 基因组删除项目给出的记录号仅通过前面的字母 Y 不同。 |
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